1．黃花菜性平、微涼、味甘，一般人群均可食用，尤其適合孕婦、產婦、正處于生長發育階段的青少年、中老年人、工作疲勞的人及病患者食用。
2．新鮮黃花菜中含有秋水仙堿，秋水仙堿本身雖無毒，但經過胃腸道的吸收，在體內氧化為“二秋水仙堿”，則具有較大的毒性，可造成胃腸道中毒癥狀，會使人嗓子發干、口渴，胃有燒灼感、惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉，嚴重者還會出現血便、血尿或尿閉甚至死亡。由于鮮黃花菜的有毒成份秋水仙堿是水溶性的，且在高溫60℃時可減弱或消失，因此食用時，應先將鮮黃花菜用開水焯過，再用清水浸泡2個小時以上，撈出用水洗凈后再烹飪食用，這樣秋水仙堿就能破壞掉，食用鮮黃花菜就安全了。但為預防鮮黃花菜中毒，每次不要多吃，每次進食量不宜超過50克，且不宜連續食用。建議將新鮮黃花菜蒸熟后曬干，若需要食用，取一部分加水泡開，再進一步烹調。
3．最好食用黃花菜干制品，因為其在生產過程中已經消除了有毒成分；食用干品時，最好在食用前先用溫水泡發（黃花菜若用冷水發制，香味不易激出；若用開水激，發出的黃花菜發艮，發成率低，故以溫水浸泡為宜），然后用清水或溫水進行多次浸泡清洗后再食用，這樣可以去掉殘留的有害物質，如二氧化硫等。
4．調理時，黃花菜中的花蕊會溶化在湯里，因而呈現暗褐色，如果不喜歡，可以在烹煮前先將花蕊摘除。
5．黃花菜適用于涼拌（應先焯熟）、炒、汆湯或做配料。
6．黃花菜是近于濕熱的食物，潰瘍病、腸損傷、胃腸不和的人，以少吃為好；平素痰多，尤其是哮喘病者，不宜食用。
7．患有皮膚瘙癢癥者忌食。有人食用鮮黃花菜會產生過敏反應，是由于其中的花粉所致，可將黃花菜的花蕊及花粉除去，并用涼水浸泡后再炒食。